Однако, вегетарианство как система питания подходит далеко не всем и имеет ряд побочных эффектов:

1. Риск развития железодефицитной анемии — железо из растительных продуктов усваивается хуже, чем из животных. Всасыванию железа препятствует большое количество фитиновой кислоты, содержащейся в растительной пище. 

2. Высокая вероятность дефицитов (особенно на фоне нарушения работы ЖКТ): 

• белка — для усвоения необходим оптимальный уровень кислотности желудочного сока. Растительный белок усваивается хуже, чем животный, и имеет неполный набор аминокислот;
• жирорастворимых витаминов (А, D, Е, К) — витамины А и D отсутствуют в растительной пище, для большинства европейцев характерно нарушение перехода бета-каротина в активную форму витамина А. Всасывание и усвоение жирорастворимых витаминов зависит от нормального функционирования желчного пузыря и желчеоттока;
• минералов — при воспалительных заболеваниях кишечника, повышении кишечной проницаемости нарушается всасывание макро- и микроэлементов.

3. Повышенный риск остеопороза — дефицит витамина D (участвует в кальциево-фосфорном обмене) и белка в растительном рационе приводит к снижению минеральной плотности костей.

4. Вероятность кариеса — кислоты фруктов и овощей при недостаточной гигиене полости рта могут повышать чувствительность зубной эмали и способствовать развитию кариеса.